Initialement publié en ligne et dont la publication est prévue dans le volume de juin 2026 de la revue scientifique The Lancet Regional Health – Amériques, sous-projet d'oncologie de la carte du génome brésilien apporte des preuves sans précédent sur l’impact de la génomique sur les soins oncologiques au Brésil. L'étude réalisée dans le cadre de PROADI-SUS montre qu'entre 7,1 % et 10,7 % des patients atteints d'un cancer du sein, de la prostate et colorectal présentent des variantes germinales pathogènes ou probablement pathogènes associées à une prédisposition héréditaire. La découverte gagne encore plus de pertinence lorsqu'elle est analysée avec les données familiales, qui montrent que parmi les proches testés, 38 % présentaient la même altération génétique, consolidant le potentiel du dépistage en cascade comme stratégie de prévention et de diagnostic précoce.
En pratique, les résultats démontrent que les tests génétiques ne se limitent pas au patient, mais s'étendent à la famille, permettant d'identifier les individus à haut risque avant que la maladie ne se développe. Il s’agit d’un mouvement qui fait passer les soins contre le cancer d’une approche centrée sur le traitement à un modèle intégrant la prévention, la surveillance et la stratification des risques basés sur des preuves génomiques.
« Lorsque nous trouvons un changement génétique héréditaire chez le patient, nous sommes en mesure d'enquêter de manière beaucoup plus directe sur les membres de leur famille respective, en recherchant exactement ce même changement. Cela rend le processus plus simple, plus rapide et plus accessible. Dans l'étude, nous avons vu que 38% des membres de la famille testés présentaient également ce changement, ce qui montre qu'il est possible d'identifier les personnes à risque plus élevé avant même l'apparition de la maladie, ouvrant un espace pour la prévention et le diagnostic précoce », explique l'urologue et chirurgien oncologue Gustavo Cardoso Guimarães, directeur de l'Institut de Robotique d'urologie, d'oncologie et de chirurgie (IUCR), coordinateur des services d'oncologie chirurgicale BP et chercheur principal de l'étude.
Les données montrent également que la présence de mutations héréditaires varie selon le type de tumeur. La fréquence la plus élevée a été observée dans le cancer du sein, avec 10,7 % des cas, suivi du cancer de la prostate, avec 9,2 %, et du cancer colorectal, avec 7,1 %. Cette distribution reflète le rôle déjà connu de gènes tels que BRCA1, BRCA2 et TP53 dans les tumeurs du sein, d'ATM, CHEK2 et HOXB13 dans les tumeurs de la prostate et de gènes de réparation de l'ADN tels que MLH1, MSH6 et PMS2 dans les tumeurs colorectales.
« Les résultats montrent qu'environ 10 % des patients sont porteurs de variantes germinales pertinentes, mais ce nombre varie en fonction du type de tumeur. Dans le cancer du sein, par exemple, cette proportion est plus élevée, tandis que dans le cancer colorectal, elle est plus faible, bien que toujours significative.
PROADI-SUS et le flux d'études intégré
L'étude a été développée dans le cadre du Programme d'Appui au Développement Institutionnel du Système de Santé Unifié, PROADI-SUS, qui permet de structurer des projets en partenariat avec d'excellents hôpitaux. Dans le cas de la branche oncologie de la carte brésilienne du génome, la conception relie les centres de référence répartis dans tout le pays à un laboratoire central de génomique, coordonné par BP.
Le flux de soins commence par l'inclusion des patients récemment diagnostiqués avec un cancer, passe par la collecte de données cliniques, épidémiologiques et familiales et par l'obtention d'échantillons de sang et de tissus tumoraux. Ces échantillons sont soumis au séquençage du génome entier, permettant une analyse intégrée des variantes germinales et somatiques. Le processus comprend un conseil génétique avant et après le test et, dans les cas positifs, la proposition de tests ciblés aux membres de la famille.
Ce modèle crée un pont direct entre la recherche et la pratique clinique, permettant de transmettre les résultats au patient et à sa famille avec des recommandations basées sur les directives internationales. Dans le même temps, il consolide une base de données robuste pour de futures analyses, élargissant ainsi l’impact potentiel sur la santé publique. Comme l'explique Guimarães, il s'agit d'une stratégie qui, lorsqu'elle est progressivement intégrée au SUS, peut contribuer à réduire les inégalités d'accès au diagnostic génétique et à qualifier la prise de décision clinique à différents niveaux de soins.
Le profil clinique et les facteurs de risque renforcent la pertinence du dépistage
Outre les résultats génétiques, l’étude fournit un aperçu détaillé des patients inclus. L'âge moyen au diagnostic variait entre 55 ans pour le cancer du sein, 65,3 ans pour le cancer de la prostate et 58,9 ans pour le cancer colorectal. Il y avait une prédominance de femmes, reflétant le poids du cancer du sein dans l'échantillon, et une majorité d'individus se déclaraient bruns.
Les données sur le mode de vie montrent des différences pertinentes entre les groupes. Le tabagisme était moins fréquent chez les patientes atteintes d'un cancer du sein, tandis que la consommation d'alcool était plus élevée chez les patientes atteintes d'un cancer de la prostate. Le régime alimentaire a montré des tendances similaires entre les trois types de tumeurs, avec une consommation élevée de sucre raffiné et une consommation fréquente d'aliments ultra-transformés, en plus d'une forte prévalence d'un mode de vie sédentaire.
Un autre point important est l’histoire familiale. Les données montrent que 75,3% des patients ont signalé au moins un parent atteint de cancer, avec une fréquence élevée de cas chez les parents du premier et du deuxième degré. Parmi ces membres de la famille, les tumeurs les plus courantes comprenaient les néoplasmes de la prostate, du sein, du côlon (gros intestin), du poumon et hématologiques, soulignant la diversité des manifestations associées à une prédisposition génétique.
Cet ensemble d'informations renforce le fait que le risque oncologique n'est pas déterminé uniquement par des facteurs génétiques isolés, mais par une interaction complexe entre l'hérédité, l'environnement et le comportement. Dans ce contexte, l’intégration de la génomique permet d’affiner cette analyse et d’orienter des stratégies plus personnalisées.
Impact direct sur la prévention et les soins du cancer
La combinaison du séquençage génomique, du conseil génétique et du dépistage en cascade indique une transformation des soins oncologiques dans le SUS. En identifiant les individus à haut risque, il devient possible d'anticiper les diagnostics, d'ajuster les stratégies de surveillance et, dans certains cas, de mettre en œuvre des mesures préventives avant l'apparition de la maladie.
« Ce modèle intégré montre que nous pouvons aller au-delà de la recherche et atteindre le patient. Le séquençage du génome entier, associé au conseil génétique et au dépistage en cascade, nous permet d'identifier les individus à haut risque, d'orienter les stratégies de prévention et, en même temps, d'orienter le traitement basé sur les changements moléculaires. Cela a le potentiel de transformer les soins oncologiques dans le SUS, en les rendant plus précis, plus efficaces et plus axés sur le patient et sa famille », déclare Guimarães.
Outre leur impact sur la prévention, les données génomiques contribuent également au ciblage thérapeutique, notamment avec l’identification de variants somatiques qui peuvent guider l’utilisation de thérapies ciblées et influencer les décisions cliniques. L'étude démontre ainsi que la médecine de précision est viable dans le contexte du système public brésilien et peut être intégrée de manière structurée.
L'étude a été menée dans neuf centres publics de référence en oncologie répartis dans les cinq régions du Brésil, reflétant la population et la diversité épidémiologique du pays. L'initiative fait partie du programme brésilien sur le génome et a été financée par le ministère de la Santé, à travers PROADI-SUS.
