Les recherches menées par l'Institut Butantan et 23 autres institutions ont défini une nouvelle nomenclature pour les souches du virus de la dengue. Les dénominations ont déjà commencé à être utilisées depuis septembre 2024 par les participants à l'étude, notamment l'Université de Yale, aux États-Unis, l'Université d'Oxford, au Royaume-Uni, la Fondation Oswaldo Cruz (Fiocruz) et l'Institut Butantan, au Brésil.
« Étant donné qu'elle a été développée de manière consensuelle par plusieurs institutions nationales et internationales, (l'adoption de la nouvelle nomenclature) ne dépend pas de l'approbation formelle de l'Organisation Mondiale de la Santé (OMS). Cependant, on s'attend à ce que l'OMS et les réseaux de surveillance régionaux commencent à l'utiliser comme référence, comme cela s'est déjà produit avec d'autres virus », souligne le bioinformaticien du Centre de Surveillance Virale et d'Évaluation Sérologique (CeVIVAS) et du Cycle Cellulaire. Laboratoire de l'Institut Butantan (LCC), Alex Ranieri.
Selon l'institut, l'objectif de la nouvelle nomenclature est de faciliter la surveillance des mutations pouvant survenir avec le virus et de favoriser la communication entre les laboratoires et les autorités sanitaires, permettant de surveiller de nouvelles lignées potentielles présentant un risque épidémiologique.
La recherche Une nouvelle nomenclature de lignée pour faciliter la surveillance génomique du virus de la dengue (Une nouvelle nomenclature de lignée pour aider à la surveillance génomique du virus de la dengue, en traduction libre) a été publiée dans la revue scientifique PLOS Biology.
Nomenclature
Le virus de la dengue est composé de quatre sérotypes (DENV-1, DENV-2, DENV-3 et DENV-4) et chacun présente des variations génétiques différentes, totalisant 17 génotypes. Le nouveau système propose deux niveaux supplémentaires (lignées majeures et lignées mineures), permettant une classification plus détaillée et standardisée de la diversité virale.
Dans le nouveau schéma de nomenclature, les génotypes sont indiqués par des chiffres romains et en dessous se trouvent deux niveaux hiérarchiques : les lignées majeures, représentées par des lettres et les lignées mineures, indiquées par des chiffres séparés par des points : DENV-3III_C.2 est le sérotype 3 du virus de la dengue, le génotype III, la lignée majeure C, la lignée mineure 2.
« Alors qu'un génotype peut couvrir des virus de plusieurs continents, une lignée spécifique peut refléter une circulation limitée à une région ou à un pays. L'article dans lequel le système a été publié montre, par exemple, que la lignée DENV-2II_A n'a été identifiée que dans l'hémisphère oriental. Ainsi, si cette lignée apparaissait sur un autre continent, cela indiquerait une nouvelle voie d'introduction, permettant une réponse rapide des autorités sanitaires », souligne Ranieri.
Selon lui, la nouvelle nomenclature peut influencer indirectement le processus de vaccination contre la maladie. Le nouveau système identifie des mutations spécifiques qui définissent chaque lignée et certains de ces changements peuvent influencer la réponse immunitaire induite par les vaccins.
« Grâce à une surveillance continue des lignées, il est possible de détecter précocement les variantes présentant un potentiel d'évasion immunitaire et d'évaluer s'il existe un impact sur l'efficacité du vaccin. Cela offre une base scientifique pour ajuster plus précisément les futures formulations de vaccins. »
En 2024, les pays où circulent les quatre sérotypes de la dengue ont signalé plus de 13 millions de cas. Le Brésil est le pays avec le plus grand nombre de cas (10,2 millions), suivi de l'Argentine (581,5 mille), du Mexique (558,8 mille), de la Colombie (321 mille) et du Paraguay (295,7 mille), selon l'Organisation panaméricaine de la santé (OPS).
La dengue est une maladie virale transmise par le moustique Aedes aegypti, qui met en danger plus de 100 millions de personnes par an dans le monde, selon l'Organisation mondiale de la santé (OMS), notamment dans les pays tropicaux comme le Brésil. (Avec des informations de l'Agência Brasil)
