Une étude dirigée par Fiocruz a analysé la circulation des virus grippaux au Brésil tout au long de la saison 2025 et a confirmé que les vaccins utilisés pendant cette période étaient efficaces contre les principales souches circulant dans le pays. Cause de la grippe, le virus de la grippe se caractérise par la diversité des types et sous-types et un taux élevé de variation génétique, ce qui nécessite une mise à jour périodique des vaccins et une surveillance continue.
Basée sur les données du réseau national de surveillance des laboratoires de virus de la grippe, collectées entre août 2024 et août 2025, l'analyse a souligné la prédominance de la grippe A(H1N1)pdm09 sur le territoire brésilien, en plus de la circulation simultanée d'autres souches du virus, comme la grippe B (Victoria) et le sous-type A(H3N2).
Des cas isolés de souches contenant une mutation pouvant affecter la réponse à l'Oseltamivir, le principal antiviral utilisé dans le Système de Santé Unifié (SUS), ont également été identifiés. Selon les auteurs, les résultats étaient occasionnels et n’indiquent pas une dissémination, mais renforcent l’importance d’une surveillance génomique et antigénique constante, qui permet de suivre l’évolution du virus au fil du temps et d’évaluer les impacts possibles sur les vaccins et les traitements.
Selon la virologue Paola Resende, du Laboratoire des virus respiratoires, exanthématiques, entérovirus et urgences virales du CIO, l'analyse a renforcé l'importance et l'efficacité de la vaccination, même face aux variations génétiques observées entre 2024 et 2025. « Du point de vue du laboratoire, tant les analyses génétiques que les tests antigéniques ont montré que les vaccins étaient capables d'inhiber les virus circulant au Brésil, confirmant l'efficacité du vaccin pendant cette période », a expliqué.
Le chercheur a toutefois mis en garde contre la faible adhésion à la vaccination, notamment parmi les groupes prioritaires définis par le ministère de la Santé, comme les personnes âgées, les enfants, les femmes enceintes et les personnes présentant des comorbidités. Selon elle, l’élargissement de la couverture vaccinale est essentiel pour renforcer la protection collective et réduire les risques de cas graves et d’hospitalisations.
Effort de réseau
Après les changements provoqués par la pandémie de Covid-19 dans la dynamique de circulation des virus respiratoires, la grippe a progressivement repris son schéma saisonnier au Brésil, ce qui renforce l'importance de la surveillance de la grippe. Dans ce scénario, les résultats ont été présentés dans l'article Panorama moléculaire et antigénique des virus grippaux circulant au Brésil au cours de la saison 2025publié en format pré-imprimé en janvier 2026.
Les analyses étaient basées sur plus de 106 000 échantillons collectés dans différentes régions du Brésil entre août 2024 et août 2025, provenant à la fois de cas de syndrome grippal et de syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS). Les travaux ont combiné le séquençage génétique des virus – pour identifier les sous-types, les lignées et les mutations – avec des tests antigéniques – qui évaluent si les virus en circulation continuent d’être reconnus par les anticorps induits par les souches vaccinales.
Concernant les échantillons analysés, environ 12,8 % ont été testés positifs à la grippe. Sur le nombre total de cas confirmés, la grippe A(H1N1)pdm09 était responsable de la plus grande partie des infections, représentant environ 40 % des enregistrements, suivie par la grippe B de la lignée Victoria, avec environ 30 %. Le sous-type A(H3N2) avait une circulation plus limitée, autour de 7 % des cas. Dans les enregistrements du syndrome respiratoire aigu sévère associé à la grippe, l'A(H1N1)pdm09 s'est également imposé comme l'agent principal, étant présent dans la majorité des cas hospitalisés et dans près de la moitié des décès confirmés par la grippe au cours de la période analysée.
Les analyses génomiques ont indiqué la circulation simultanée de différents sous-groupes de virus grippaux A et B dans différentes régions du pays. Selon la virologue Paola Resende, ce comportement reflète la dynamique naturelle du virus, qui peut varier dans le temps et se manifester différemment selon les régions, influencée par des facteurs tels que le climat et les mouvements de personnes.
« La circulation du virus de la grippe ne suit pas un schéma fixe. Une fois entré dans le pays, la propagation dépend de facteurs tels que le flux de personnes, le climat et les caractéristiques régionales, qui peuvent générer des pics à différents moments de l'année », a-t-il résumé.
Malgré cette diversité génétique, les sous-types analysés restent compatibles avec les souches utilisées dans les vaccins. La vaccination reste donc une stratégie efficace pour se protéger contre la grippe. Les chercheurs ont également étudié les marqueurs génétiques associés à la résistance aux médicaments antiviraux, tels que l'Oseltamivir, le principal médicament utilisé pour traiter la grippe dans le SUS. Selon les auteurs, les résultats étaient rares, ne se sont pas propagés et n'indiquent pas une perte d'efficacité de l'antiviral, mais renforcent l'importance d'une surveillance permanente.
L'étude est le résultat du travail du réseau national de surveillance des laboratoires de virus de la grippe, qui fonctionne de manière intégrée avec le système mondial de surveillance de la grippe coordonné par l'OMS. Au total, l'initiative a bénéficié de la participation de 46 institutions et 116 co-auteurs.
Au Brésil, cet effort de réseau implique directement trois Centres nationaux de la grippe (NIC) — l'Institut Evandro Chagas (IEC), l'Institut Adolfo Lutz (IAL) et l'Institut Oswaldo Cruz lui-même —, qui reçoivent les échantillons envoyés par les Laboratoires centraux de santé publique (LACEN) et effectuent des analyses complémentaires en laboratoire.
Le travail s'appuie également sur une action intégrée de surveillance épidémiologique municipale, étatique et nationale, renforçant la capacité du pays à détecter, surveiller et réagir à la circulation des virus grippaux. En plus de surveiller la circulation des virus dans le pays et dans le monde, le réseau subventionne des réunions internationales chargées de définir et de mettre à jour les souches qui composent le vaccin contre la grippe. Une grande partie des données générées par l’étude ont même été soumises à l’OMS sous la forme d’un rapport technique en septembre 2025, contribuant à la définition de la composition du vaccin antigrippal dans l’hémisphère Sud pour la saison 2026.
« Il existe un réseau mondial qui travaille sans relâche pour surveiller les virus de la grippe, et ce travail soutient les réunions internationales qui décident de mettre à jour les souches qui composent le vaccin contre la grippe », a-t-il souligné.
Préparation aux risques émergents
En plus de guider la composition des vaccins et des antiviraux, la surveillance de la grippe joue un rôle stratégique dans la détection précoce des risques émergents, notamment l’émergence de virus à potentiel pandémique. Au cours de la saison analysée, un cas rare de grippe A(H3N2)v a été enregistré au Paraná, associé à une exposition à des porcs. Bien que l’enquête n’ait pas identifié de transmission durable entre humains, l’épisode a souligné l’importance de maintenir des systèmes capables de détecter rapidement les virus qui franchissent la barrière des espèces.
« La grippe a un potentiel épidémique et pandémique. Il est donc essentiel de maintenir une surveillance sensible et constante, capable d'identifier rapidement aussi bien les mutations associées à la résistance aux antiviraux que les événements d'origine zoonotique, avant qu'ils ne se propagent », a déclaré Paola Resende.
Selon les auteurs, la circulation des virus grippaux chez les humains et les animaux crée des opportunités de réarrangements génétiques pouvant donner naissance à de nouveaux variants. Dans ce contexte, la surveillance génomique et épidémiologique soutient non seulement les actions immédiates de santé publique, mais renforce également la capacité du pays à répondre aux futurs scénarios d'épidémie et de pandémie, en collaboration avec le ministère de la Santé et l'Organisation mondiale de la santé. (Avec informations de l'agence Fiocruz)