L'analyse génétique des tissus infectés par le SARS-COV-2 peut conduire à des traitements plus efficaces

Rien qu'au Brésil, depuis 2020, plus de 700 000 personnes sont mortes de complications Covid-19 et près de 40 millions de cas de maladie ont été confirmés. Bien que la maladie ne soit plus considérée comme une urgence de santé publique, il est certain que son impact était immense et que des études sur le virus peuvent aider la société à mieux se préparer à toute future pandémie.

En ce sens, des chercheurs de l'Université pontificale catholique de Paraná (PUCPR) et de l'Université du Queensland, en Australie, ont rejoint pour analyser les tissus des patients décédés en raison de la maladie et établir un profil d'expression génique du virus. L'expression des gènes contrôle qui – et à quel moment – les gènes sont activés dans une cellule, ce qui déterminera les fonctions et les caractéristiques spécifiques de cette même cellule. L'étude « Le profilage monocellulaire in situ fait la lumière sur l'emplacement IFI27 pendant l'infection SARS-COV-2 » («Le profil unique in situ clarifie l'emplacement de l'IFI27 pendant l'infection SARS-COV-2» a été publié dans la revue médicale Ebiomedicine, soutenue par le prestigieux The Lancet.

La principale conclusion du travail était que les zones de macrophages riches, c'est-à-dire les cellules de défense du corps qui agissent dans le système immunitaire, expriment la protéine IFI27 à des niveaux plus élevés. De plus, dans le cas de patients infectés par le SRAS-COV-2, il y avait plus de macrophages exprimant IFI27 par rapport aux personnes non infectées. L'IFI27 est la protéine 27 induite par l'interféron alpha (IFN I), le principal immunorégulateur dans les infections virales.

«Cette molécule, IFI27, joue donc un rôle important dans les maladies virales, notamment Covid-19. Ceci est très intéressant car c'est une molécule qui augmente l'expression d'autres protéines impliquées dans l'inflammation, ce qui déclenche les symptômes chez le patient », explique Lucia de Noronha, professeur au programme de troisième cycle en sciences de la santé (PPGC) PUCPR School of Medicine Medicine PUCP et les sciences de la vie et l'un des auteurs de l'étude.

«Lorsque vous savez quels gènes ils sont exprimés, vous savez également que les routes sont activées, par exemple, quelle manière inflammatoire, quelle voie de mort cellulaire. Avec ces informations, il est possible de mieux définir le traitement », ajoute le professeur Cleber Machado de Souza à la Pucpr School of Medicine and Life Sciences.

La technologie disponible dans les laboratoires de l'Université du Queensland et difficile à atteindre au Brésil a permis l'analyse de centaines de gènes en même temps dans un seul échantillon. Les chercheurs ont donc réussi à avoir accès à un panel d'expression génique très large.

«Même si Covid-19 n'est plus considéré comme une pandémie, la maladie existe toujours. De plus, tout ce que nous pouvons apprendre d'un virus pandémique sera sûrement valable demain, car la projection est que les futures pandémies devraient également être virales », explique Lucia.