Fiocruz et l’UFRJ avancent dans l’innovation capable d’anticiper de nouvelles épidémies infectieuses

Chaque année, des milliers de personnes sont touchées par des épidémies de maladies infectieuses. En outre, selon des documents de la Commission européenne, la pandémie de Covid-19 a révélé que le système international actuel de surveillance et d’alerte des maladies infectieuses ne fonctionne pas assez rapidement face à un pathogène respiratoire à propagation rapide. Dans ce contexte, les autorités et les agences de santé de différents pays reconnaissent qu’une détection et une réponse plus rapides aux épidémies et aux pandémies dépendent d’une surveillance mondiale solide, basée sur des données comparables.

Publiée dans le Journal of Medical Internet Research (JMIR) Public Health and Surveillance, une étude menée par le Center for Data and Knowledge Integration for Health (Citoyens/Fiocruz Bahia), en collaboration avec des chercheurs d’autres unités de la Fiocruz, de l’Université fédérale de Rio de Janeiro (UFRJ) et de la Fondation Rockefeller, reconnaît au niveau international le modèle et la mise en œuvre du système ÆSOP, développé pour la surveillance épidémiologique et le soutien à l’identification et production d’alertes précoces concernant l’apparition d’éventuelles épidémies infectieuses, telles que le H1N1 et le Covid-19.

Chercheur d’études et coordinateur adjoint du Cidacs/Fiocruz Bahia, Pablo Ramos rapporte que les travaux certifient les bases de la création et de la mise en œuvre du système ÆSOP. « Nous y présentons les principales lignes directrices pour le choix des sources de données utilisées pour la surveillance, comprenant le suivi des services de soins primaires, la vente de médicaments et les médias sociaux et l’actualité », a-t-il expliqué. Pour le chercheur, la publication « présente au monde l’importance d’un regard innovant sur la combinaison d’approches numériques et moléculaires utilisant des sources de données alternatives et sanitaires dans un système de surveillance de pointe, capable d’anticiper les épidémies à potentiel pandémique. ».

En outre, une autre étude récente publiée par l’équipe scientifique d’ÆSOP a prouvé la capacité d’utiliser les données des soins de santé primaires (SSP) pour anticiper les épidémies de maladies respiratoires, en utilisant les données de visites pour plaintes de grippe et de syndromes respiratoires dans l’État de Bahia. En comparant certains modèles « traditionnels » existants avec le développement du système ÆSOP, le chercheur a présenté quelques implémentations exclusives et suggestives pour les systèmes de surveillance de nouvelle génération, telles que « l’importance d’un choix approprié de sources de données ; l’importance de partager les données de manière éthique et de garantir la confidentialité des individus ; l’importance de garantir la sensibilité de la détection des événements, complétée ensuite par une spécificité pouvant être obtenue via les données génomiques ; la possibilité d’adapter des systèmes tels que ÆSOP à d’autres conditions d’importance médicale ».

Pour le chercheur de Fiocruz, ce système n’a pas l’intention de remplacer les systèmes actuels, mais d’intégrer le contexte de données existant, de compléter et de fournir un soutien, en présentant une vision de « construire un système de surveillance de nouvelle génération ». Concernant les prochaines étapes du développement du système ÆSOP, Pablo rapporte : « nous travaillons actuellement à la consolidation du système, afin que les alertes puissent être transmises prochainement au ministère de la Santé. En parallèle, suite à l’atelier annuel du projet qui a eu lieu à la fin de l’année dernière, nous sommes en pourparlers avec l’État d’Amazonas pour mener un projet pilote local dans cette région, ce qui nous permettra de recueillir des retours directs sur l’utilité et les besoins des utilisateurs ».

Le développement du système, coordonné par le chercheur de la Fiocruz Manoel Barral-Netto, a été réalisé en collaboration avec des responsables de la santé publique, du domaine de recherche et des institutions partenaires, nourrissant l’ÆSOP avec des perspectives qui dépassent le cadre de la recherche et cherchant à mettre en œuvre améliorations du tableau de bord interactif et facile à utiliser pour les gestionnaires de soins de santé. Dans le contexte du Brésil, le système ÆSOP sera utilisé par le ministère de la Santé (MS), qui sera chargé d’utiliser et d’émettre des alertes aux responsables de la surveillance sanitaire des municipalités et de l’État.

Le projet ÆSOP vise à répondre aux futurs besoins de partage de données pour la surveillance. Ainsi, il contribue à un système fédéré de surveillance épidémiologique doté des outils nécessaires et d’un environnement ouvert à la coopération, et peut même soutenir la flexibilité du modèle, en s’adaptant aux contextes et en aidant à identifier des maladies et des associations spécifiques, comme la Dengue. (Avec des informations de l’agence de presse Fiocruz)